Kalabakan terkenal dengan peristiwa Konfrontasi Indonesia-Malaysia 1963 yang berlaku pada 29 Disember 1963. Peristiwa ini telah mengorbankan seorang pegawai dan tujuh anggota Platun 1 Kompeni A3 RAMD, manakala 18 orang anggota lagi tercedera. Peristiwa berdarah ini berlaku pada tanggal 29 Disember 1963.